Africa-Places.com ने रुकनगिरि में लगभग 5 स्कूलों को सूचीबद्ध किया है। रुकनगिरि के कुछ टॉप रेटेड स्कूलों हैं। ब्रेनट्रस्ट प्राइमरी स्कूल, मेकरेरे कॉलेज ऑफ बिजनेस एंड कंप्यूटर स्टडी, कैनन निदिंबिर्वे बाइबिल कॉलेज, मेकरेरे कॉलेज ऑफ बिजनेस एंड कंप्यूटर स्टडी & कैनन निदिंबिर्वे बाइबिल कॉलेज।